O IDJ, I.P, tem por missão a implementação de uma política global e descentralizada nos domínios do desporto e da juventude em articulação com as entidades públicas e privadas, especialmente com o associativismo desportivo, juvenil, estudantil e com as autarquias locais.
O IDJ, I. P., sugere medidas em matéria desportiva, com vista ao desenvolvimento do desporto integrado e inclusivo e adota medidas preventivas para a ética no desporto, bem como estimula a implementação de programas para a integração da atividade física e desportiva nos estilos de vida saudável dos cabo-verdianos, através de disponibilização de meios técnicos, humanos e financeiros.
Igualmente, o IDJ, I. P., visa ajudar na definição, monitorização e execução das políticas públicas para a juventude, através da adoção de medidas de estímulo à participação cívica dos jovens em atividades políticas, sociais, económicas, culturais e educativas. Nesse leque de funções, deve também estimular o associativismo e a mobilidade dos jovens e fomentar a adoção de programas destinados a responder às necessidades e especificidades do universo jovem.